В ноябре 2009 одновременно с выпуском Assassin's Creed II вышла в свет французская графическая новелла. В ней был представлен новый герой – римский ассасин по имени Aquilus («aquil» в переводе с латинского означает «орел»). Однако больше внимания его истории было уделено в следующем томе, релиз которого состоялся 12 ноября 2010 года.

Следует отметить, что французская новелла во многом отходит от канона, что дает основание называть эту серию «альтернативным развитием» событий игры. В частности, в начале первого тома представлена сцена побега Объекта 16 из психиатрической больницы, хотя в игре утверждается, что Объект 16 мертв. В новелле также упоминается артефакт Анкх (вероятно, одна из Частиц Эдема), который способен воскрешать людей на короткое время, хотя в игре он ни разу не появлялся. Таким образом, другие события, обозначенные в новелле, а также новые персонажи, не относятся к оригинальной серии игр. Вероятней всего, французская графическая новелла Assassin's Creed получит продолжение.

Том 1. Desmond.
Почему Дезмонд Майлз заключен в секретной научной лаборатории? Кто эти странные ученые, которые проводят над ним эксперименты? Какой секрет содержит его генетическая память? Зачем копаться в прошлом его предка, который состоял в Ордене Ассасинов? Знают ли ученые, что пробуждать воспоминания истинного ассасина опасно?

  

Том 2. Aquilus.
Дезмонд присоединяется к ассасинам, вместе с ними он начинает поиск загадочного артефакта. Чтобы отыскать его, Дезмонд должен окунуться в прошлое своего предка, римского ассасина Аквилуса. В этот раз Дезмонд столкнется с опасностями и предательством, а также узнает, что прошлое может дать ему гораздо больше, чем можно представить.

  

Том 3. Accipiter.
Аквилус жаждет отомстить за смерть своего отца, а также вернуть украденный артефакт Анкх. По следам убийц он отправляется в Рим. Тем временем несколько веков спустя, варвары, возглавляемые Ассасином Accipiter, вот-вот начнут атаку на Италию... Дезмонд, путешествуя по памяти своих предшественников, продолжает обучение. Вскоре ему придется столкнуться не только с новыми врагами, но и с сюрпризами, приготовленными для него предками.